Erfahrene Taucher können selbstständig mit Buddy am Hausriff tauchen, wo auch Early Morning- und Nachttauchgänge durchgeführt werden.
Insgesamt gibt es die Auswahl zwischen fast 50 Tauchplätzen, die mit dem Boot überwiegend in wenigen Minuten erreichbar sind. Die Tauchgänge werden von PADI-Instruktoren und einheimischen Tauchguides begleitet. Sipalay weist eine einmalige Unterwasserwelt auf. Die Tauchgebiete sind keine typischen Großfischgewässer, sondern ein echter Geheimtipp für Liebhaber kleiner Schönheiten und einer intakter Rifflandschaften. Besonders Fotografen sind immer wieder begeistert von der Vielfalt der Unterwasserwelt in unmittelbarer Nähe der Basis. Mit etwas Glück lassen sich auch große Rochen, Schildkröten und Haie sichten. Besonderheit sind auch ganze Terrassen aus Tischkorallen, die oft den Grund bedecken.
Die Kombination mit einer mehrtägigen Safari bietet sich an. Neben den rund 50 direkt vorgelagerten Tauchplätzen werden von Anfang März bis Ende Mai Mehrtagestouren zu den 120 km westlich gelegenen Cagayan-Riffen durchgeführt, die ein ganz besonderen Höhepunkt auf der Tauchreise bietet. Außerdem werden von Oktober bis März regelmäßige 6tägige Safaris zwischen Sipalay nach Moalboal angeboten und sich ideal zu einer Rundreise kombinieren lässt.